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Estructura, función, evolución, y regulación del mecanismo rotacional de la F1FO- ATP sintasa bacteriana y mitocondrial, el nanomotor ubicuo y esencial que produce en todos los seres vivos la energía vital del ATP. Descubrimos un nuevo inhibidor natural de la F1-ATPasa o subunidad zeta (ζ) en α-proteobacterias como Paraccoccus denitrificans, con implicaciones en la regulación y evolución de las enzimas bacteriana y mitocondrial, y con aplicaciones en biorremediación y diseño de antibióticos.
Publicaciones
Lista de publicaciones con arbitraje internacional de los últimos 5 años (2014-2018; F!= Factor de Impacto)
1. “The ζ subunit of the F1FO-ATP synthase of α-proteobacteria controls rotation of the nanomotor with a different structure”. Zarco-Zavala, M., Morales-Ríos, E., Mendoza-Hernández, G., Ramírez-Silva, L., Pérez-Hernández, G., and García-Trejo., J.J. The FASEB Journal 28(5):2146-57. doi: 10.1096/fj.13-241430. Epub 2014 Feb 12. (2014) (FI: 5.043)
2. “Novel Mutations in the Transcriptional Activator Domain of the Human TBX20 in Patients with Atrial Septal Defect”. Monroy-Muñoz, I.E., Pérez-Hernández, N., Rodríguez-Pérez, J.M., Muñoz-Medina, J.E., Angeles-Martínez, J, García-Trejo, J.J., Morales-Ríos, E., Massó, F., Sandoval-Jones, J.P., Cervantes-Salazar, J., García-Montes, J.A., Calderón-Colmenero, J., and Vargas-Alarcón, G. BioMed Research International, Article ID 718786. 2015:718786. doi: 10.1155/2015/718786. Epub Mar 5 (2015). (FI: 1.58).
3. “New insights on the Mechanism of the K+-independent Activity of Crenarchaeota Pyruvate Kinases.” De la Vega-Ruíz, G., Domínguez-Ramírez, L., Riveros-Rosas, H., Guerrero-Mendiola, C., Torres-Larios, A., Hernández-Alcántara, G., García-Trejo, J.J., and Ramírez-Silva, L. PlosOne. 10(3):e0119233. doi: 10.1371/journal.pone.0119233. eCollection
Epub Mar 26 (2015). (FI: 3.23).
4. “Structure of a catalytic dimer of the α- and β-subunits of the F-ATPase from Paracoccus denitrificans at 2.3 Å resolution”. Morales-Ríos, E., Montgomery, M.G., Leslie, A.G. W., García-Trejo, J. J. and Walker , J.E. Acta Crystallographica. 71(Pt 10):1309-17 (2015). (FI: 0.53).
5. “The inhibitory mechanism of the ζ subunit of the F1FO-ATPase nanomotor of Paracoccus denitrificans and related α-proteobacteria”. García-Trejo, J.J., Zarco-Zavala, M., Mendoza-Hoffmann, F., Hernández-Luna, E., Ortega, R., and Mendoza-Hernández. G. The Journal of Biological Chemistry. 291(2):538-546. pii: jbc.M115.688143. (2016) [Epub ahead of print] Nov 6 (2015). (FI:4.573)
6. “The ζ subunit inserts its inhibitory N-terminus into the αDP/βDP interface of the F1-ATPase from Paracoccus denitrificans to block rotation of γ in a similar way to IF1 in the mitochondrial nanomotor”. García-Trejo, J.J., Zarco-Zavala, M., Mendoza-Hoffmann, F., Hernández-Luna, E., Ortega, R., and Mendoza-Hernández. G. Biocimica et Biophysica Acta Bioenergetics. Vol 1857 Supplement pp e54 (2016), (FI=4.932).
7. “The contribution of two isozymes to the pyruvate kinase activity of Vibrio cholerae: one K+-dependent constitutively active and another K+-independent with essential allosteric activation”. Guerrero-Mendiola, C.,
García-Trejo, J.J., Encalada, R., Saavedra, E., y Ramírez-Silva,L. Plos One Jul 7;12(7):e0178673. doi: 10.1371/journal.pone.0178673. eCollection 2017 (2017). (F!:3.23)
8. “The Biological Role of the ζ Subunit as Unidirectional Inhibitor of the F1FO-ATPase of Paracoccus denitrificans.” Mendoza-Hoffmann, F., Pérez-Oseguera, A., Cevallos, M.A., Zarco-Zavala, M., Ortega, R., Peña-Segura, C., Espinoza-Simón, E., Uribe-Carvajal, S., y García-Trejo, J.J. Cell Reports. Jan 23;22(4):1067-1078. Doi:10.1016/j.celrep.2017.12.106.Epub 2018 Jan 28 (2018), (FI=8.282).
9. “Unidirectional regulation of the F1FO-ATP synthase nanomotor by the ζ pawl-ratchet inhibitor protein of Paracoccus denitrificans and related α-proteobacteria”. Zarco-Zavala, M., Mendoza-Hoffmann, F., y García-Trejo,
J.J. Biochimica et Biophysica Acta-Bioenergetics (BBA-Bioenergetics). En prensa (2018), (FI=4.932)
10. “Control of rotation of the F1FO-ATP synthase nanomotor by an inhibitory α-helix from unfolded ε or intrinsically disordered ζ and IF1 proteins”. Mendoza-Hoffmann, F., Zarco-Zavala, M., Ortega, R. y García-Trejo, J.J.
Journal of Bioenergetics and Biomembranes. Enviado (2018), (F!=2.576).
