El interés de mi laboratorio se centra en el estudio de los diversos procesos epigenéticos que regulan la expresión genética y en particular, el papel que juega la organización tridimensional del genoma al interior del espacio nuclear en dicho proceso.

Nos interesa entender que tan dinámicas son las estructuras genómicas en 3D desde los dominios topológicos, hasta las asas de cromatina entre genes y elementos de regulación, durante procesos en donde existen cambios drásticos en los niveles de transcripción génica tales como la diferenciación celular y los cambios en expresión durante un ciclo circadiano.

Publicaciones

1. Mayra Furlan-Magaril*, Masami Ando-Kuri, Rodrigo G. Arzate-Mejía, Jorg Morf, Jonathan Cairns, Cesar A. Poot-Hernández, Simon Andrews, Csilla Várnai, Boo Virk, Steven W. Wingett, Peter Fraser. The global and promoter-centric 3D genome organization temporally resolved during a circadian cycle. Gen Biol., 22, 162 (2021).*Corresponding author. Factor de impacto 13.58
2. Esquivel-López, A., Arzate-Mejía, R.,Pérez-Molina, R., Furlan-Magaril, M*. In-Nucleus Hi-C in Drosophila Cells. J. Vis.Exp. (175), e62106, doi:10.3791/62106 (2021). *Corresponding author. Factor de impacto 1.36
3. Delgado-Olguín P, Oktaba K and Furlan-Magaril M*. Editorial: Chromatin Spatial Configuration and Function in Metazoans. Front. Genet. and Front in Cell and Dev Biol. 12:734981. doi: 10.3389/fgene.2021.734981. (2021) *Corresponding author. Factor de impacto 3.78, 6.68
4. Penagos-Puig Andrés, Furlan-Magaril Mayra*. Heterochromatin as an Important Driver of Genome Organization. Front. Cell Dev. Biol., 18 September 2020. *Corresponding author. Factor de impacto 6.68
5. Arzate-Mejía RG, Josué Cerecedo-Castillo A, Guerrero G, Furlan-Magaril M*, Recillas-Targa F*. In situ dissection of domain boundaries affect genome topology and gene transcription in Drosophila. Nat Commun. 2020 Feb 14;11(1):894. doi: 10.1038/s41467-020-14651-z. PMID: 32060283 Free PMC article. *Corresponding author. Factor de impacto 14.9
6. Saldaña-Meyer R, Rodriguez-Hernaez J, Escobar T, Nishana M, Jácome-López K, Nora EP, Bruneau BG, Tsirigos A, Furlan-Magaril M, Skok J, Reinberg D. RNA Interactions Are Essential for CTCF-Mediated Genome Organization. Mol Cell. 2019 Nov 7;76(3):412-422.e5. doi: 10.1016/j.molcel.2019.08.015. Factor de impacto 17.9
7. Karina Jácome-López & Mayra Furlan-Magaril*. Topología genómica, transcripción y replicación, tres procesos funcionalmente entrelazados. Revista de Educación Bioquímica (REB) 39(1):14-25, 2020. *Corresponding author
8. Morf J, Wingett SW, Farabella I, Cairns J, Furlan-Magaril M, Jiménez-García LF, Liu X, Craig FF, Walker S, Segonds-Pichon A, Andrews S, Marti-Renom MA, Fraser P. RNA proximity sequencing reveals the spatial organization of the transcriptome in the nucleus. Nat Biotechnol. 2019 Jul;37(7):793-802. doi: 10.1038/s41587-019-0166-3. Factor de impacto 54.9
9. Javierre B, Schoenfelder S, Furlan-Magaril M, Wingett et al., Promoter Capture Hi-C: high-resolution genome-wide profiling of promoter interactions. J Vis Exp. (2018). Jun 28;(136). Factor de impacto 1.36
10. Novo CL, Javierre BM, Cairns J, Segonds-Pichon A, Wingett SW, Freire-Pritchett P, Furlan-Magaril M, Schoenfelder S, Fraser P, Rugg-Gunn PJ. Long-Range Enhancer Interactions Are Prevalent in Mouse Embryonic Stem Cells and Are Reorganized upon Pluripotent State Transition. Cell Rep. (2018) Mar 6;22(10):2615-2627. Factor de Impacto 9.4
11. Adam J. Rubin*, Brook C. Barajas*, Mayra Furlan-Magaril*, Vanessa Lopez-Pajares, Maxwell R. Mumbach, Imani Howard, Daniel S. Kim, Lisa D. Boxer, Jonathan Cairns, Mikhail Spivakov, Steven W. Wingett, Minyi Shi, Zhixin Zhao, William J. Greenleaf, Anshul Kundaje, Michael Snyder, Howard Y. Chang, Peter Fraser, and Paul A. Khavari. Dynamic and pre-established enhancer-promoter contacts in terminal differentiation. Nature Genetics (2017) ng.3935. *First author. Factor de impacto 38.3
12. Freire-Pritchett P, Schoenfelder S, Várnai C, Wingett SW, Cairns J, Collier AJ, García-Vílchez R, Furlan-Magaril M, Osborne CS, Fraser PJ, Rugg-Gunn PJ, Spivakov M. Global reorganisation of cis-regulatory units upon lineage commitment of human embryonic stem cells. Elife. (2017) Mar 23;6. Factor de impacto 8.14

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